Скачать статью в PDF формате
Научная статья
УДК 619:616.9
https://doi.org/10.31016/1998-8435-2023-17-1-84-90
Идентификация таксономической принадлежности
криптоспоридий у поросят в условиях
северо-запада РФ
при помощи молекулярно-генетических методов
Андрей Леонидович Кряжев 1, Артём Сергеевич Новиков 2
1 kamarnett@mail.ru, https://orcid.org/0000-0001-7015-8063
2 vetnovikov@yandex.ru, https://orcid.org/0000-0002-6919-8524
Аннотация
Цель исследований – определение таксонов представителей рода Cryptosporidium у поросят при помощи молекулярно-генетических методик в условиях северо-запада РФ.
Материалы и методы. Пробы фекалий брали у поросят разного возраста в хозяйствах различных форм собственности, отличающихся климатогеографической зоной и технологией содержания животных на территории Вологодской области. При помощи микроскопических методов исследования выявляли «положительные» пробы, в которых присутствовали представители рода Cryptosporidium, сортировали их и подвергали глубокой заморозке. Затем пробы исследовали с использованием оборудования ЦКП «Геномные технологии, протеомика и клеточная биология» ФГБНУ ВНИИСХМ». Идентификацию видов рода Cryptosporidium в пробах фекалий сельскохозяйственных животных проводили с помощью высокопроизводительного секвенирования ампликонных библиотек фрагментов гена 18S рРНК, полученных в результате проведения вложенной полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Результаты и обсуждение. Была создана система праймеров для вложенной ПЦР, амплифицирующих потенциально видоспецифичный участок гена 18S рРНК размером 393 н.о. Последовательность праймера ILL_R2_ Zheng была модифицирована с внесением вырожденных позиций с целью сделать праймер более универсальным. В результате секвенирования библиотек фрагментов гена 18S рРНК, полученных с использованием выбранных праймеров, и последующего таксономического анализа полученных нуклеотидных последовательностей, было показано, что во всех исследованных образцах присутствуют представители только одного вида Сryptosporidium scrofarum.
Ключевые слова: криптоспоридиоз, Cryptosporidium scrofarum, ооцисты, таксономия, ПЦР, ДНК, секвенирование, 18S рРНК, поросята, Вологодская область
Благодарности. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-26-00002 (https://rscf.ru/project/22-26-00002/).
Прозрачность финансовой деятельности: в представленных материалах или методах авторы не имеют финансовой заинтересованности.
Конфликт интересов отсутствует.
Для цитирования: Кряжев А. Л., Новиков А. С. Идентификация таксономической принадлежности криптоспоридий у поросят в условиях северо-запада РФ при помощи молекулярно-генетических методов // Российский паразитологический журнал. 2023. Т. 17. № 1. С. 84–90. https://doi.org/10.31016/1998-8435-2023-17-1-84-90
© Кряжев А. Л., Новиков А. С., 2023