242-249 Молекулярная диагностика представителей рода Cryptosporidium у свиней в условиях частных фермерских хозяйств Вологодской области Северо-Западного Федерального Округа РФ. Кряжев А. Л., Новиков А. С.

Молекулярная диагностика представителей рода
Cryptosporidium у свиней в условиях частных
фермерских хозяйств Вологодской области
Северо-Западного Федерального Округа РФ

Андрей Леонидович Кряжев ¹, Артём Сергеевич Новиков ²

Цель исследований – определение зараженности и степени выделения ооцист с последующей идентификацией таксонов представителей рода Cryptosporidium у поросят различного возраста при помощи новейших молекулярно-генетических методик в условиях частных фермерских хозяйств Вологодской области Северо-Западного федерального округа РФ.

Материалы и методы. Данные исследования в Российской Федерации выполнены впервые. Исследования проводили в условиях частных фермерских хозяйств по выращиванию свиней, расположенных на территории Вологодской области Северо-Западного Федерального Округа РФ с января по сентябрь 2022 г. Фекалии брали от поросят различных возрастов, а именно поросят-сосунов в возрасте до 1 мес., отъемышей (1–3 мес.), поросят на откорме (от 4 мес. и старше), а также от подсосных свиноматок. Возрастные группы были сформированы с учетом технологических параметров содержания животных в хозяйствах. При помощи микроскопических методов исследования выявляли «положительные» пробы, в которых обнаружены ооцисты рода Cryptosporidium, и число ооцист. В дальнейшем пробы исследовали с использованием оборудования ЦКП «Геномные технологии, протеомика и клеточная биология» ФГБНУ ВНИИСХМ». Идентификацию видов рода Cryptosporidium в пробах фекалий животных проводили с помощью высокопроизводительного секвенирования ампликонных библиотек фрагментов гена 18S рРНК, полученных в результате проведения nested (вложенной) ПЦР.
 
Результаты и обсуждение. Представители рода Cryptosporidium были выявлены в каждой исследуемой возрастной группе, причем как у животных с признаками расстройства пищеварения, так и у животных без клинических признаков болезни. Средняя инвазированность поголовья криптоспоридиями в частных фермерских хозяйствах составила 32,4%. Наиболее инвазированы ооцистами криптоспоридий поросята-откормочники в возрасте 4–6 мес. – 72%. В результате секвенирования библиотек фрагментов гена 18S рРНК, полученных с использованием выбранных праймеров, и последующего таксономического анализа полученных нуклеотидных последовательностей было показано, что во всех исследованных образцах присутствуют представители только вида Cryptosporidium scrofarum.

Ключевые слова: криптоспоридиоз, Cryptosporidium scrofarum, ооцисты, ПЦР, ДНК, секвенирование, 18S рРНК, поросята, Вологодская область, Российская Федерация

Благодарность. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-26-00002 (https://rscf.ru/project/22-26-00002/). Молекулярно-генетические исследования выполнены с использованием оборудования ЦКП «Геномные технологии, протеомика и клеточная биология» ФГБНУ ВНИИСХМ» (г. Пушкин, СПб.).

Прозрачность финансовой деятельности: никто из авторов не имеет финансовой заинтересованности в представленных материалах или методах.
 
Конфликт интересов отсутствует.

Для цитирования: Кряжев А. Л., Новиков А. С. Молекулярная диагностика представителей рода Cryptosporidium у свиней в условиях частных фермерских хозяйств Вологодской области Северо-Западного Федерального Округа РФ // Российский паразитологический журнал. 2023. Т. 17. № 2. С. 242–249. https://doi.org/10.31016/1998-8435-2023-17-2-242-249

© Кряжев А. Л., Новиков А. С., 2023